RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539232.1

LMO3-220, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 580 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-220ENST00000539232 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 PRO1933Q9H354 126 aa5.57□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 E5RGE8 158 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 K7EP13 123 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 M0QYG6 137 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 CCSO14618 274 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 CTXN2P0C2S0 81 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 TRGC1P0CF51 173 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 AREGP15514 252 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 GNRHRP30968 328 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 LGALS7P47929 136 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 ARL6IP1Q15041 203 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 KCTD9Q7L273 389 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 OR1P1Q8NH06 330 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 Q8WTZ3 238 aa5.56□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 PRR25Q96S07 402 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 SRD5A3Q9H8P0 318 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 GPR132Q9UNW8 380 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 NSG2Q9Y328 171 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 TEX22C9J3V5 150 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 H3BQ15 152 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 EREGO14944 169 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 CYB5BO43169 146 aa5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 CNIH1O95406 144 aa5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 OR10J1P30954 320 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 HRH1P35367 487 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 AKR1C3P42330 323 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 TPPP2P59282 170 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 RUNX1Q01196 453 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 TNXAQ16473 311 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 RTL8BQ17RB0 113 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 ZNF585BQ52M93 769 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 SLC35G3Q8N808 338 aa5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 OR51H1Q8NH63 302 aa5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 S4R3C0 116 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 LYSTQ99698 3801 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 AGPAT2O15120 278 aa5.54□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 S1PR2O95136 353 aa5.54□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 REG1AP05451 166 aa5.54□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 PI3P19957 117 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 G0S2P27469 103 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 ZNF616Q08AN1 781 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 RAB32Q13637 225 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 PMS2P11Q13670 270 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 ZNF266Q14584 549 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 LEMD1Q68G75 181 aa5.54□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 ZNF429Q86V71 674 aa5.54□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 FRZBQ92765 325 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 MOB3AQ96BX8 217 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.54□□□□□ -1.52
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LMO3-220ENST00000539232 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 LINC01619G3V211 115 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 KBTBD11O94819 623 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 NDUFB8O95169 186 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 IGKV1-39P01597 117 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 IGHV3-23P01764 117 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 IGKV1D-39P04432 117 aa5.53□□□□□ -1.52
LMO3-220ENST00000539232 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
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