RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531546.1

CASP4-210, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 2

Gene CASP4, Length 921 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-210ENST00000531546 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 A0A0A6YYH2 397 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 TMEM235A6NFC5 223 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 A6NJ64 397 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 FAM223BA6NKX1 122 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 C16orf90A8MZG2 172 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 J3QRK9 145 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 ATP6V1G2O95670 118 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 IGLV1-51P01701 117 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 OR9G9P0C7N8 305 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 SYNJ2BPP57105 145 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 GNG2P59768 71 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 HERV-K104P61576 105 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 CDK10Q15131 360 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 TNXAQ16473 311 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 RPEL1Q2QD12 228 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 LGALS9CQ6DKI2 356 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 ZNF773Q6PK81 442 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 OR4S2Q8NH73 311 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 VSTM2AQ8TAG5 236 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 CXorf58Q96LI9 332 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 OR51E2Q9H255 320 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 ETV7Q9Y603 341 aa3.5□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 E5RGE8 158 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 TEX46H3BTG2 121 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 RS1O15537 224 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 AIREO43918 545 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 OR2A4O95047 310 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 HRASP01112 189 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 APELAP0DMC3 54 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 SDC2P34741 201 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 MAS1LP35410 378 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 KIR2DS2P43631 304 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 ARPC4P59998 168 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 B2MP61769 119 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 RHOGP84095 191 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 ATP5G2Q06055 141 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 ZNF415Q09FC8 603 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 MSMO1Q15800 293 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 IDNKQ5T6J7 187 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 LCN12Q6JVE5 192 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 Q6ZRP5 223 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 HOGA1Q86XE5 327 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 Q8N402 240 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 NECAP1Q8NC96 275 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 OR2K2Q8NGT1 345 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 OR2A7Q96R45 310 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 DIABLOQ9NR28 239 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 MBD2Q9UBB5 411 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 SPATA2Q9UM82 520 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 NSG2Q9Y328 171 aa3.49□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 SMCO3A2RU48 225 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 EPM2AB3EWF7 344 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 CDK2AP2O75956 126 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 OR2J3O76001 311 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 KBTBD11O94819 623 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 DHFRP00374 187 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 TRBV12-3P01733 135 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 PRH1P02810 166 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 NQO2P16083 231 aa3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CASP4-210ENST00000531546 FCGR2CP31995 323 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.5 ms