RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 PTPN13Q12923 2485 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 CFHR2P36980 270 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 LCN2P80188 198 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 FA2HQ7L5A8 372 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 RPRMQ9NS64 109 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 NOTCH2Q04721 2471 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM178BH3BS89 294 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 K7EP34 96 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 NUDT3O95989 172 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF134P52741 427 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 CCL20P78556 96 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 Q8N976 141 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 HCFC1P51610 2035 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 C15orf65H3BRN8 121 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF253O75346 499 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 OR9G9P0C7N8 305 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A6P12236 298 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 KIR2DS2P43631 304 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 GATA4P43694 442 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM213A2RRL7 107 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 F2RL2O00254 374 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 DLX1P56177 255 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 NRGNQ92686 78 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 RPEQ96AT9 228 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 TCF19Q9Y242 345 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV2-14P01704 120 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 NPY1RP25929 384 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 PAX9P55771 341 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 ARL16Q0P5N6 197 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 DUX5Q96PT3 197 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 OR8B2Q96RD0 313 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 AGMATQ9BSE5 352 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 PSMB3P49720 205 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 LGALS4P56470 323 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 MUC21Q5SSG8 566 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF525Q8N782 197 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 RCHY1Q96PM5 261 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-208ENST00000519076 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 FAM231BA6NCW3 169 aa6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 LHBP01229 141 aa6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 DEFA4P12838 97 aa6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 POU2AF1Q16633 256 aa6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 ST20Q9HBF5 79 aa6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.4□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GUS0 222 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 C7orf71A4D174 169 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 FOXH1O75593 365 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-48P01763 117 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 COL8A2P25067 703 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 UTF1Q5T230 341 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 OR4F5Q8NH21 305 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 CENPEQ02224 2701 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SHISA9B4DS77 424 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-208ENST00000519076 SERF1AO75920 110 aa6.39□□□□□ -1.39
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