RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 IGSF23A1L1A6 192 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 MARCH11A6NNE9 402 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 WRBO00258 174 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 TSPAN4O14817 238 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SHOXO15266 292 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 CRYZL1O95825 349 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 IFNA7P01567 189 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 HLA-DMBP28068 263 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ADMP35318 185 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 VAMP2P63027 116 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 NHLH2Q02577 135 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 FAM209BQ5JX69 171 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SSX9Q7RTT3 188 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PDPNQ86YL7 162 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 Q8NAQ8 132 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 OR4S2Q8NH73 311 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 WFDC1Q9HC57 220 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 NACAE9PAV3 2078 aa5.22□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 EPM2AB3EWF7 344 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 H3BP45 60 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 SYNGR2O43760 224 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 OR2J3O76001 311 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 ATG12O94817 140 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 IAPPP10997 89 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 CAV2P51636 162 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 OR2B8PP59922 312 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF124Q15973 351 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 C15orf32Q32M92 178 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 NECAP1Q8NC96 275 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 OR4A5Q8NH83 315 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 STOML3Q8TAV4 291 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 MARC2Q969Z3 335 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 RAB40CQ96S21 281 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 SCRT1Q9BWW7 348 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 RBKSQ9H477 322 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM140Q9NV12 185 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.21□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF320A2RRD8 509 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 TAAR5O14804 337 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 CST7O76096 145 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 IGHV3-23P01764 117 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 NMBP08949 121 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 NQO2P16083 231 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 ARL3P36405 182 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2KP61086 200 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 ERVK-16P61578 105 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 POU2AF1Q16633 256 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 NDUFA5Q16718 116 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 RTL8BQ17RB0 113 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 AARDQ4LEZ3 155 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 SPINK9Q5DT21 86 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 CLLU1Q5K131 121 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 OR4A47Q6IF82 309 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 BAP18Q8IXM2 172 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 OR5B3Q8NH48 314 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM8Q96KF7 97 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 PSENENQ9NZ42 101 aa5.2□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 UPK2O00526 184 aa5.19□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 APOA2P02652 100 aa5.19□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 MYOD1P15172 320 aa5.19□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 ARL16Q0P5N6 197 aa5.19□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 CLINT1Q14677 625 aa5.19□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 PRSS8Q16651 343 aa5.19□□□□□ -1.58
CASQ1-203ENST00000481081 KLK9Q2XQG4 91 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms