RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VSIG4Q9Y279 399 aa6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HPRT1P00492 218 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HRASP01112 189 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHG4P01861 327 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NQO2P16083 231 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMB8P28062 276 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ETV6P41212 452 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCR6P51684 374 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIQKQ629K1 86 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COPZ2Q9P299 210 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.34□□□□□ -1.39
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UPK2O00526 184 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRGV3P03979 118 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL7P13232 177 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HLA-GP17693 338 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB9AP51151 201 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB25P57735 213 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPPP2P59282 170 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAS2R31P59538 309 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RND3P61587 244 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LAGE3Q14657 143 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM16LQ309B1 348 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPINK9Q5DT21 86 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF695Q8IW36 515 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM230Q96A57 120 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LITAFQ99732 161 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRRT1Q99946 306 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HINT2Q9BX68 163 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COA4Q9NYJ1 87 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S4R3C0 116 aa6.33□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0G2JRQ6 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H0Y980 276 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV1-5P01602 117 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERPINE2P07093 398 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5AC1P0C628 307 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AKR1C4P17516 323 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S100GP29377 79 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INPP1P49441 399 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BORCS5Q969J3 196 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9orf85Q96MD7 179 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAA60Q9H7X0 242 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BET1LQ9NYM9 111 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COMMD9Q9P000 198 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.32□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 L7N2F9 121 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV12-3P01733 135 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-23P01764 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLL1P15814 213 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AP3S2P59780 193 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF45Q02386 682 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POU2AF1Q16633 256 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COMMD1Q8N668 190 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEC22AQ96IW7 307 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF580Q9UK33 172 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G10O15496 165 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RS1O15537 224 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2J3O76001 311 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BTCP35070 178 aa6.3□□□□□ -1.4
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