RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NCOR2-208	ENST00000429285	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NCOR2-208	ENST00000429285	CCL4	P13236	92 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NCOR2-208	ENST00000429285	LILRA6	Q6PI73	481 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NCOR2-208	ENST00000429285	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		11.21	□□□□□ -0.61
NCOR2-208	ENST00000429285	C15orf61	A6NNL5	157 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	FNDC10	F2Z333	226 aa		11.21	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	MLNR	O43193	412 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	MRAP	Q8TCY5	172 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF415	Q09FC8	603 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	CD5L	O43866	347 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	MUC21	Q5SSG8	566 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	WDR90	Q96KV7	1748 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	LHX2	P50458	406 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		11.2	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285		Q5BKY6	102 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	NBAS	A2RRP1	2371 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	FOXS1	O43638	330 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	YPEL1	O60688	119 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	YPEL2	Q96QA6	119 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF525	Q8N782	197 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	MMP23A	O75900	390 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	EVI2A	P22794	236 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	GLRX	P35754	106 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	FGF11	Q92914	225 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	RASL10A	Q92737	203 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	TNFRSF14	Q92956	283 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285		Q6ZT83	130 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	AMBP	P02760	352 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	SRD5A1	P18405	259 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	RNF125	Q96EQ8	232 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	TRAC	P01848	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	IGHV3-23	P01764	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM258	P61165	79 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	OVOL1	O14753	267 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	CCL1	P22362	96 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	COLCA2	A8K830	154 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	GUSBP1	Q15486	140 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	AMELY	Q99218	206 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285		A6NNC1	897 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	LINC01545	Q5VT33	79 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	KIR3DS1	Q14943	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	HTN3	P15516	51 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NCOR2-208	ENST00000429285	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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