RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 PLXNB1O43157 2135 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 PDE6DO43924 150 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 MPDU1O75352 247 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 TOX4O94842 621 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 IGKV1D-33P01593 117 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 IGKV1-33P01594 117 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 TREML4Q6UXN2 200 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 Q6ZN92 141 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 RITA1Q96K30 269 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 FUT9Q9Y231 359 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 CD33P20138 364 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 GLMPQ8WWB7 406 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC25A22Q9H936 323 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 MED13LQ71F56 2210 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 HTR1DP28221 377 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 KLRD1Q13241 179 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 COX19Q49B96 90 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 GNG13Q9P2W3 67 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ZFP92A6NM28 416 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 LY6LH3BQJ8 138 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 OVOL3O00110 214 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 PRTN3P24158 256 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 PLP1P60201 277 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 C2orf83Q53S99 150 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 MRAP2Q96G30 205 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 MGST2Q99735 147 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 THYN1Q9P016 225 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PPI3 338 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 HELTA6NFD8 242 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 E7EUB6 86 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 CNTFRP26992 372 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 LCN2P80188 198 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 ICAM4Q14773 271 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 TEPPQ6URK8 271 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 TEX45Q8NA69 505 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 CCL19Q99731 98 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 DPM3Q9P2X0 92 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 H7BYZ3 331 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 ACTL6BO94805 426 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 OPRK1P41145 380 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 MMD2Q8IY49 270 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 MTURNQ8N3F0 131 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PRD5 423 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PRF3 423 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PRM7 423 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 OR2T8A6NH00 312 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 CGB1A6NKQ9 187 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 ODF3BA8MYP8 253 aa8.01□□□□□ -1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 FNDC10F2Z333 226 aa8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 270.5 ms