RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM50AO95807 157 aa5.59□□□□□ -1.51
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RNU1-38P-201ENST00000362817 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
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RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.55□□□□□ -1.52
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RNU1-38P-201ENST00000362817 WRBO00258 174 aa5.55□□□□□ -1.52
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