RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	RAB1C	Q92928	201 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	PRDX2	P32119	198 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	FXYD7	P58549	80 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	MTURN	Q8N3F0	131 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	OR9G1	Q8NH87	305 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624		V9GYV3	84 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ZNF716	A6NP11	495 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	MMP23A	O75900	390 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	MOS	P00540	346 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	MAGEA5	P43359	124 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	IL11RA	Q14626	422 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TMEM42	Q69YG0	159 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624		U3KQA8	63 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	AGFG2	O95081	481 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ORM1	P02763	201 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	MPV17	P39210	176 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	NKX2-8	O15522	239 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	VSTM5	A8MXK1	200 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624		K7EN84	100 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	REG1A	P05451	166 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	AREG	P15514	252 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ACP1	P24666	158 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	PSMB2	P49721	201 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	DPF1	Q92782	380 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TMEM160	Q9NX00	188 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624		A0A1B0GUT8	65 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	WNT2	P09544	360 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	HSD52	Q0P140	79 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	VWC2	Q2TAL6	325 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	MUC3A	Q02505	3323 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	YPEL1	O60688	119 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	AZU1	P20160	251 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	CLDN18	P56856	261 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TWIST1	Q15672	202 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	PSG3	Q16557	428 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	OR52E5	Q8NH55	327 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	GPR82	Q96P67	336 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624		A0A0G2JMM0	328 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624		A0A1W2PPB8	328 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	GFRA3	O60609	400 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TGFA	P01135	160 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	ASCL4	Q6XD76	172 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	HES1	Q14469	280 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	DEFB125	Q8N687	156 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PXN-222	ENST00000637624	TNC	P24821	2201 aa		10.03	□□□□□ -0.8

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