RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 A0A0J9YX75 114 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 F6UB75 175 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 RS1O15537 224 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 PPYP01298 95 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 IGKV1-17P01599 117 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 LPAR6P43657 344 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 PSMB3P49720 205 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 GNGT1P63211 74 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 PRCDQ00LT1 54 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 HES5Q5TA89 166 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 Q6ZSA8 131 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 OR4X1Q8NH49 305 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
GGA3-212ENST00000582376 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 A0A096LPF7 62 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 CORTO00230 105 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 BUB3O43684 328 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 ADAP1O75689 374 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 RAB6AP20340 208 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 HOXA5P20719 270 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 F2RP25116 425 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 SNCAP37840 140 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 FXYD4P59646 89 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 CDNFQ49AH0 187 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 HACD4Q5VWC8 232 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 AMTNQ6UX39 209 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 Q8WTZ3 238 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 C16orf74Q96GX8 76 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 DOK5Q9P104 306 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 V9GY05 133 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 A8MTW9 85 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 RLN1P04808 185 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 MT1HL1P0DM35 61 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 OPRK1P41145 380 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 TMEM17Q86X19 198 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 OR4A16Q8NH70 328 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 TMEM203Q969S6 136 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 KLK11Q9UBX7 282 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 M0R2Z0 102 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 SOCS3O14543 225 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 PSCAO43653 123 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 ARL6IP5O75915 188 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 GAS8-AS1O95177 125 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 IL4P05112 153 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 PTHLHP12272 177 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 TAS2R60P59551 318 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 GNG2P59768 71 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 DHODHQ02127 395 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 MLANAQ16655 118 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 SPINK9Q5DT21 86 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 BAP18Q8IXM2 172 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 Q8N814 137 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 BORCS5Q969J3 196 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 LINC01587Q99440 93 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 RPRMQ9NS64 109 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 TMEM235A6NFC5 223 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 IGLC1P0CG04 106 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 HTN1P15515 57 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 SCXQ7RTU7 201 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 GPR141Q7Z602 305 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 GPR146Q96CH1 333 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-212ENST00000582376 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.18□□□□□ -1.42
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