RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 ASIPP42127 132 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 FXYD4P59646 89 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 DEFB1P60022 68 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 KIR3DS1Q14943 382 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 FAM78BQ5VT40 261 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 HACD4Q5VWC8 232 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 OR4A16Q8NH70 328 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 Q8WTZ3 238 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM203Q969S6 136 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 VCX3BQ9H321 246 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.61□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 RNF213Q63HN8 5207 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 PPYP01298 95 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 PSMB3P49720 205 aa6.6□□□□□ -1.35
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SMAD3-211ENST00000559460 PRCDQ00LT1 54 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF79Q15937 498 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 HES5Q5TA89 166 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM17Q86X19 198 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.6□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 H3BNG1 76 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 NXPH4O95158 308 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 C1QBP02746 253 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 RLN1P04808 185 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 HTN1P15515 57 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 F2RP25116 425 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 LPAR6P43657 344 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 TIGITQ495A1 244 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 CDNFQ49AH0 187 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 C16orf74Q96GX8 76 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 RPRMQ9NS64 109 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 U3KQE9 123 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 V9GY05 133 aa6.59□□□□□ -1.35
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0B4J293 547 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PRM2P04554 102 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 IL4P05112 153 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 RAB6AP20340 208 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PAX9P55771 341 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 HERV-K104P61576 105 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 SLC35G3Q8N808 338 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 OR4X1Q8NH49 305 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.58□□□□□ -1.36
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SMAD3-211ENST00000559460 LINC01587Q99440 93 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 GFI1Q99684 422 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 VCXQ9H320 206 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 DOK5Q9P104 306 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 A0A0J9YX75 114 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 F6UB75 175 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 CBX5P45973 191 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 OR10A3P58181 314 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 GPR141Q7Z602 305 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 ENY2Q9NPA8 101 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 KLK11Q9UBX7 282 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 DBX1A6NMT0 343 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 M0R2Z0 102 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 BUB3O43684 328 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 RLN2P04090 185 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 AZU1P20160 251 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 EVI2AP22794 236 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 HSPA13P48723 471 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 SPINK9Q5DT21 86 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 AHSA2Q719I0 299 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 BEST4Q8NFU0 473 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 UFD1Q92890 307 aa6.56□□□□□ -1.36
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