RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 LYRM9A8MSI8 78 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 ATG12O94817 140 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 NUDT3O95989 172 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 IGKV1-17P01599 117 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 IGKV3-20P01619 116 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 RFX2P48378 723 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 HSPA13P48723 471 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 FXYD7P58549 80 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 TIGITQ495A1 244 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 FRZBQ92765 325 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 FXYD6Q9H0Q3 95 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 PMP2P02689 132 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 PSMB9P28065 219 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 PSG9Q00887 426 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 CLINT1Q14677 625 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 SPINK9Q5DT21 86 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 COQ8AQ8NI60 647 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 SLC25A38Q96DW6 304 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 BUB3O43684 328 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 TMEM127O75204 238 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 IGKV1-39P01597 117 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 IGKV1D-39P04432 117 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 IL4P05112 153 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 IGLC1P0CG04 106 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 SLC25A4P12235 298 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 PSMB3P49720 205 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 KRTAP10-2P60368 255 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 ZNF709Q8N972 641 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 SSR3Q9UNL2 185 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 A0A1W2PPQ1 181 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 F5H768 121 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 M0QYG6 137 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 OR10J1P30954 320 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 RORCP51449 518 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 AKR1C2P52895 323 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 TAS2R20P59543 309 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 B2MP61769 119 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 TSPAN5P62079 268 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 DHODHQ02127 395 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 ZNF79Q15937 498 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 LINC00052Q96N35 136 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 Q9H8V8 135 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 ATP5G1P05496 136 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 NAT1P18440 290 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 SDC2P34741 201 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 HTR2BP41595 481 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 ATP5G3P48201 142 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 PAX9P55771 341 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 MLANAQ16655 118 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 IDNKQ5T6J7 187 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 Q5VSD8 79 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 SSX7Q7RTT5 188 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 ABHD1Q96SE0 405 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 Q9H3A6 140 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 KLK11Q9UBX7 282 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-228ENST00000551473 EBAG9O00559 213 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 EREGO14944 169 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 TOMM40O96008 361 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 RD3LP0DJH9 198 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 DEFB130BP0DP73 79 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 DEFB130AP0DP74 79 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 ETV6P41212 452 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 RND2P52198 227 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 UCP3P55916 312 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 MXD1Q05195 221 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 BSXQ3C1V8 233 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 C18orf15Q96N68 181 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 A0A0B4J293 547 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-228ENST00000551473 ISLRO14498 428 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms