RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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PTPRB-208ENST00000550358 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 DDTP30046 118 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRB-208ENST00000550358 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF492Q9P255 531 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 LY6DQ14210 128 aa6.96□□□□□ -1.29
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 RASL10AQ92737 203 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-208ENST00000550358 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 H3BTX0 84 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 ZNHIT1O43257 154 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-208ENST00000550358 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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