RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 PSMB11A5LHX3 300 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 METTL21EPA6NDL7 271 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCDC160A6NGH7 325 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR5H14A6NHG9 310 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM25AB3EWG3 89 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM25CB3EWG5 89 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM25GB3EWG6 89 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 J3QRK9 145 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 M0QZK8 103 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 M0R1X1 148 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB29O14966 203 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 HPGDSO60760 199 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OPN1MWP04001 364 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGF1P05019 195 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PSMB8P28062 276 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC00315P59091 139 aa3.14□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 DEFA5Q01523 94 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 KIR2DS1Q14954 304 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PSG5Q15238 335 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 MMDQ15546 238 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 DEFB136Q30KP8 78 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 UBE2NLQ5JXB2 153 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR8H1Q8NGG4 311 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPX8Q8TED1 209 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 P2RX4Q99571 388 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR51J1Q9H342 316 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa3.14□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.13□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 A6NJ64 397 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 E7EUB6 86 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 H3BMQ9 156 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 I3L521 148 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 CA2P00918 260 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPYP01298 95 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHG4P01861 327 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 APOA1P02647 267 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.13□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.13□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PDPNQ86YL7 162 aa3.13□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.13□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLCC1Q96S66 551 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RASL11BQ9BPW5 248 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC35D1Q9NTN3 355 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.13□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 COL7A1Q02388 2944 aa3.13□□□□□ -1.91
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TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF98A6NK75 572 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 H7C2Y5 167 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 CTDSPLO15194 276 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAMP3O60896 148 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 RBBP9O75884 186 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SERF1AO75920 110 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SCGNO76038 276 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PMP2P02689 132 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF735P0CB33 412 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGLL1P15814 213 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 GNRHRP30968 328 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 TSPAN5P62079 268 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 PITPNAQ00169 270 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 DEFA6Q01524 100 aa3.12□□□□□ -1.91
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF45Q02386 682 aa3.12□□□□□ -1.91
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