RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 H2BFSP57053 126 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2KP61086 200 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TNXAQ16473 311 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 C5orf64Q2M2E5 130 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 Q5BKY6 102 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 NMSQ5H8A3 153 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 MMD2Q8IY49 270 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TEX29Q8N6K0 151 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 LRTM2Q8N967 370 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 Q8N9W7 124 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 NPBQ8NG41 125 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 OR4A16Q8NH70 328 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 OR1S1Q8NH92 325 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 OR2A7Q96R45 310 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 RASL11BQ9BPW5 248 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ATG101Q9BSB4 218 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 COMMD9Q9P000 198 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TNCP24821 2201 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CUBNO60494 3623 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GW64 132 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 MSGN1A6NI15 193 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 PRSS46E5RG02 174 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 G3V318 75 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 WRBO00258 174 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFA3O95167 84 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TSHBP01222 138 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IFNA17P01571 189 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IAPPP10997 89 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-GP17693 338 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 BCAP31P51572 246 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 S100A10P60903 97 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 RPL8P62917 257 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 SRPXP78539 464 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 NDPQ00604 133 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 SMCO1Q147U7 214 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 FXYD3Q14802 87 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 POU2AF1Q16633 256 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 PRSS8Q16651 343 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP69Q49AA0 526 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 C5orf56Q8N8D9 126 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 LFNGQ8NES3 379 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 OR5T1Q8NG75 326 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IL22RA2Q969J5 263 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf50Q96LR7 162 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 RNF5Q99942 180 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 RBKSQ9H477 322 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 RAB18Q9NP72 206 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 PARP11Q9NR21 331 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 BET1LQ9NYM9 111 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 MAST4O15021 2626 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 C15orf61A6NNL5 157 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 H3BP45 60 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ATP6V0E1O15342 81 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TCF21O43680 179 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 SSSCA1O60232 199 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PITX3O75364 302 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 CCNKO75909 580 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 ATG12O94817 140 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 PRH1P02810 166 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 AREGP15514 252 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-211ENST00000484135 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
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