RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF585BQ52M93 769 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 LY6G6FQ5SQ64 297 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 WBP1Q96G27 269 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 UPK2O00526 184 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 LEPP41159 167 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 COQ2Q96H96 371 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 PAX1P15863 534 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 PLNP26678 52 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 JMJD8Q96S16 334 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 YPEL1O60688 119 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 CCL3L1P16619 93 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 YPEL2Q96QA6 119 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 EPDR1Q9UM22 224 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 C17orf100A8MU93 164 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 BTCP35070 178 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC01587Q99440 93 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 CACNA1AO00555 2505 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV3-11P01762 117 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 TDGF1P13385 188 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 OCC1Q8TAD7 63 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF125Q96EQ8 232 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 F8VVB4 439 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 F8VWA3 439 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 DPM2O94777 84 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 CD55P08174 381 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP161Q6P656 301 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 MPDZO75970 2070 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 FGF16O43320 207 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 ADMP35318 185 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX38Q6PEX7 206 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 ST20Q9HBF5 79 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PRS3 328 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 C15orf61A6NNL5 157 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 CD7P09564 240 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 GNG5P63218 68 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 PSG8Q9UQ74 426 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 NBR2O15453 112 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SP9P0CG40 484 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 MYOD1P15172 320 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 PYYP10082 97 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 PAX2Q02962 417 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 BSPH1Q075Z2 132 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 FBLN7Q53RD9 439 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF182Q8N6D2 247 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 C18orf12Q96KH6 178 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A20O43772 301 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 UMODP07911 640 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 Q5PR19 223 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms