RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.87□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 UTF1Q5T230 341 aa4.87□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 Q8N6K4 173 aa4.87□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 U3KQ87 197 aa4.86□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 CT45A7P0DMV0 189 aa4.85□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 ZNF680Q8NEM1 530 aa4.85□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 TERB2Q8NHR7 220 aa4.85□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 PHB2Q99623 299 aa4.85□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 LINC00527Q9UJ94 153 aa4.85□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 CATR1Q13166 79 aa4.84□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 ECSCRQ19T08 205 aa4.84□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 OR5H2Q8NGV7 314 aa4.84□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.84□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 FBXL15Q9H469 300 aa4.84□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.84□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 VSIG4Q9Y279 399 aa4.84□□□□□ -1.63
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