RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258607.9

CKAP2-201, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP2, Length 3,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-201ENST00000258607 PRCDQ00LT1 54 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF329Q86UD4 541 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF98A6NK75 572 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 PPP1R2P9O14990 202 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 SPRY2O43597 315 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 NAT8Q9UHE5 227 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HELTA6NFD8 242 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 NUDT19A8MXV4 375 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 PHOX2AO14813 284 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 GNG7O60262 68 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HIST1H2BKO60814 126 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HIST1H2BJP06899 126 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 CSN3P07498 182 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HIST1H2BOP23527 126 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HIST1H2BBP33778 126 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 CFHR2P36980 270 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 MFAP2P55001 183 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HIST1H2BDP58876 126 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 DEFB1P60022 68 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HIST1H2BCP62807 126 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 C1orf159Q96HA4 380 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.29□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 AGRNO00468 2067 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 XKRY2A2RUG3 117 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 BTBD17A6NE02 478 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 P0C879 139 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 NDPQ00604 133 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 ATP6V1FQ16864 119 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 COMMD1Q8N668 190 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 PAXXQ9BUH6 204 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 CLN5O75503 358 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 MBP02144 154 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 GPR183P32249 361 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 CD69Q07108 199 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 TMEM186Q96B77 213 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 MALSU1Q96EH3 234 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 M0QZ24 198 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 CORTO00230 105 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 CXorf1O96002 111 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 USF1P22415 310 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 TFPI2P48307 235 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 PMS2P11Q13670 270 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 PRNTQ86SH4 94 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 Q8N7P7 452 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 DPM3Q9P2X0 92 aa7.28□□□□□ -1.24
CKAP2-201ENST00000258607 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 GGTLC3B5MD39 225 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 PSG1P11464 419 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 PMCHP20382 165 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 SAA4P35542 130 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 UBE2G1P62253 170 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 FAM168AQ92567 244 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 DIRC2Q96SL1 478 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 TENM4Q6N022 2769 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 ISLRO14498 428 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 CORO2AQ92828 525 aa7.27□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 A0A1W2PN81 502 aa7.26□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 F2Z2F3 143 aa7.26□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 AGAP20933 346 aa7.26□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 HLA-DMBP28068 263 aa7.26□□□□□ -1.25
CKAP2-201ENST00000258607 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms