RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	C1QB	P02746	253 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	RASSF2	P50749	326 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	RORC	P51449	518 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLDN12	P56749	244 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	ERVK-16	P61578	105 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM230	Q96A57	120 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	LINC00052	Q96N35	136 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	AP4S1	Q9Y587	144 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	MARCH11	A6NNE9	402 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	MFNG	O00587	321 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	SLC17A2	O00624	439 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	EI24	O14681	340 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	CTXN2	P0C2S0	81 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	MT1HL1	P0DM35	61 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	FCGR1A	P12314	374 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	RAB11B	Q15907	218 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF79	Q15937	498 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	COMMD9	Q9P000	198 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337		U3KQE9	123 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	DBX1	A6NMT0	343 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	RS1	O15537	224 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	SNAPC5	O75971	98 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	NXPH4	O95158	308 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	AZU1	P20160	251 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	GADD45A	P24522	165 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	TSPO	P30536	169 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	CATR1	Q13166	79 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM78B	Q5VT40	261 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q6ZSA8	131 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	TPRA1	Q86W33	373 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR51H1	Q8NH63	302 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	GFI1	Q99684	422 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	IRGM	A1A4Y4	181 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337		F6UB75	175 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	CD1A	P06126	327 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	HOXA5	P20719	270 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	GYS2	P54840	703 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	CADM3	Q8N126	398 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	COQ8A	Q8NI60	647 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	ABHD1	Q96SE0	405 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRND	Q9UKY0	176 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SPTAN1-231	ENST00000636337	KRAS	P01116	189 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	DTYMK	P23919	212 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	G6PC	P35575	357 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	PAX9	P55771	341 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	MSMO1	Q15800	293 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	CNIH2	Q6PI25	160 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM80	Q96HE8	168 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	RAB22A	Q9UL26	194 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337		H3BNG1	76 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	GYG2	O15488	501 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	CLN5	O75503	358 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	INS	P01308	110 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	TIGIT	Q495A1	244 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	SCX	Q7RTU7	201 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337		Q8N814	137 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A096LPF7	62 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A0J9YX75	114 aa		6.56	□□□□□ -1.36

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