RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 GUCD1Q96NT3 240 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 HSBP1O75506 76 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF329Q86UD4 541 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 MBD6Q96DN6 1003 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RRN3P1-202ENST00000546471 CACNA1GO43497 2377 aa7.65□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 PYYP10082 97 aa7.65□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.65□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.65□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 NUP35Q8NFH5 326 aa7.65□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.65□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.65□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 M0R2Z0 102 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV1-46P01743 117 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 PRR27Q6MZM9 219 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 NUDT11Q96G61 164 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SIAH2O43255 324 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 UBE2G1P62253 170 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TNXAQ16473 311 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 KNTC1P50748 2209 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 C20orf202A1L168 122 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 H0YJW9 148 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SFTPCP11686 197 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM177Q53S58 311 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ATOH7Q8N100 152 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 STPG4Q8N801 248 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 OR4A5Q8NH83 315 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 NPIPB3Q92617 1050 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 MUC3AQ02505 3323 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 HIGD1CA8MV81 97 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 OR2J3O76001 311 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 PDPNQ86YL7 162 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 FXYD5Q96DB9 178 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.63□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 DSCAMO60469 2012 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TSPOP30536 169 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 CAMPP49913 170 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 WT1-ASQ06250 92 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 LCN12Q6JVE5 192 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 PATE2Q6UY27 113 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SMIM12Q96EX1 92 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.62□□□□□ -1.19
RRN3P1-202ENST00000546471 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms