RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 SMPD2O60906 423 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 OR10J4P0C629 311 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ZNF146Q15072 292 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 PMCHL1Q16048 86 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ZNF503Q96F45 646 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 HES4Q9HCC6 221 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 HCFC1P51610 2035 aa7.47□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 A8MXE2 369 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 GGTLC3B5MD39 225 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 IGLV2-8P01709 118 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 CD24P25063 80 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ARR3P36575 388 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 PSG5Q15238 335 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 NRN1LQ496H8 165 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 FAM201AQ5SY85 155 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 ZNF738Q8NE65 137 aa7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
THBS3-211ENST00000541990 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.46□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.46□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.46□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 STUMQ69YW2 141 aa7.46□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.46□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.46□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 NINJ1Q92982 152 aa7.46□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.46□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.46□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 HELTA6NFD8 242 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CCL21O00585 134 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 AMY1AP04745 511 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 BET1LQ9NYM9 111 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MMP23AO75900 390 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 EDDM3AQ14507 147 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OR52E5Q8NH55 327 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 BORCS7Q96B45 105 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CHODLQ9H9P2 273 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 GCM1Q9NP62 436 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CHD6Q8TD26 2715 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CBY3A6NI87 242 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 APCSP02743 223 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PSG1P11464 419 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 USF1P22415 310 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TNFSF4P23510 183 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 FOXE3Q13461 319 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 VAMP3Q15836 100 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MPV17L2Q567V2 206 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OR4A16Q8NH70 328 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 LEAP2Q969E1 77 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.45□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OOEPA6NGQ2 149 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 OR2T8A6NH00 312 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PRSS47A8MTI9 375 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MORN2Q502X0 79 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MORN5Q5VZ52 161 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 TCF19Q9Y242 345 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 ZFHX3Q15911 3703 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 hDV102S1A0JD36 115 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 M0R1X1 148 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 SPRY3O43610 288 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MPDU1O75352 247 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 PLAUP00749 431 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 IGKV3-15P01624 115 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MT-ND6P03923 174 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 LINC00869P0C866 280 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 CA7P43166 264 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 RHOBP62745 196 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 MLANAQ16655 118 aa7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
THBS3-211ENST00000541990 WDR73Q6P4I2 378 aa7.44□□□□□ -1.22
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