RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 SCGB2A1O75556 95 aa9.34□□□□□ -0.91
LMO3-218ENST00000538020 NDUFB8O95169 186 aa9.34□□□□□ -0.91
LMO3-218ENST00000538020 IFNA5P01569 189 aa9.34□□□□□ -0.91
LMO3-218ENST00000538020 RAB9AP51151 201 aa9.34□□□□□ -0.91
LMO3-218ENST00000538020 MFAP4P55083 255 aa9.34□□□□□ -0.91
LMO3-218ENST00000538020 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
LMO3-218ENST00000538020 ATP5G2Q06055 141 aa9.34□□□□□ -0.91
LMO3-218ENST00000538020 VWC2Q2TAL6 325 aa9.34□□□□□ -0.91
LMO3-218ENST00000538020 C15orf32Q32M92 178 aa9.34□□□□□ -0.91
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LMO3-218ENST00000538020 KLHDC1Q8N7A1 406 aa9.34□□□□□ -0.91
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LMO3-218ENST00000538020 RNF114Q9Y508 228 aa9.34□□□□□ -0.91
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LMO3-218ENST00000538020 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.33□□□□□ -0.92
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LMO3-218ENST00000538020 FAM209BQ5JX69 171 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 RNF152Q8N8N0 203 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 OR4X1Q8NH49 305 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 ACY3Q96HD9 319 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 ATP6V0BQ99437 205 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 TXN2Q99757 166 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
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LMO3-218ENST00000538020 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.33□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 CUBNO60494 3623 aa9.33□□□□□ -0.92
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LMO3-218ENST00000538020 RAB31Q13636 194 aa9.32□□□□□ -0.92
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LMO3-218ENST00000538020 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.32□□□□□ -0.92
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LMO3-218ENST00000538020 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa9.31□□□□□ -0.92
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LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-48P01763 117 aa9.31□□□□□ -0.92
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LMO3-218ENST00000538020 SLC51BQ86UW2 128 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.31□□□□□ -0.92
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LMO3-218ENST00000538020 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.31□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 ZFP92A6NM28 416 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 HAX1O00165 279 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 FABP1P07148 127 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 OR10J1P30954 320 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 BTNL8Q6UX41 500 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 ZNF491Q8N8L2 437 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 ZNF709Q8N972 641 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 THAP8Q8NA92 274 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 STOML3Q8TAV4 291 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.3□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
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LMO3-218ENST00000538020 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-23P01764 117 aa9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LMO3-218ENST00000538020 CCDC140Q96MF4 163 aa9.29□□□□□ -0.92
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