RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 APCSP02743 223 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 RPL39P5Q59GN2 51 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 MIC13Q5XKP0 118 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 BATF2Q8N1L9 274 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TTC9CQ8N5M4 171 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 NPIPB3Q92617 1050 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 AJUBAQ96IF1 538 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 PARLQ9H300 379 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 C7orf69Q9H7B7 122 aa4.77□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 A0A1B0GV50 99 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 EGR1P18146 543 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 COTL1Q14019 142 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 ELOBQ15370 118 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TREML4Q6UXN2 200 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 C11orf53Q8IXP5 236 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 LINC00052Q96N35 136 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 J3QKU1 62 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 IGHV2-5P01817 119 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TRGV3P03979 118 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 HBBP68871 147 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 ZNF383Q8NA42 475 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 C16orf92Q96LL3 132 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 SGK494Q96LW2 274 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 KLHDC3Q9BQ90 382 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 RNF114Q9Y508 228 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 ASXL3Q9C0F0 2248 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 NDUFA4O00483 81 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 DEFA6Q01524 100 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 LINC00305Q7Z4B0 112 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 OR5T1Q8NG75 326 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 SMPXQ9UHP9 88 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 EXPH5Q8NEV8 1989 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 PGPA6NDG6 321 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 C15orf62A8K5M9 175 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 ATP5LO75964 103 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 CLEC12BQ2HXU8 276 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 LY6G5BQ8NDX9 201 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 EPDR1Q9UM22 224 aa4.76□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 BRCA2P51587 3418 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 NXPH3O95157 252 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 PF4V1P10720 104 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 RPL11P62913 178 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 ECSCRQ19T08 205 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TEX38Q6PEX7 206 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 SGMS2Q8NHU3 365 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 KNL1Q8NG31 2342 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 K7EM74 188 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TIMM23O14925 209 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 ICAM4Q14773 271 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 WDR86Q86TI4 376 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 DDB2Q92466 427 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 CGB3P0DN86 165 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 CGB7P0DN87 165 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.75□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 SPTBP11277 2137 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 A0A1W2PRD5 423 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 A0A1W2PRF3 423 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 A0A1W2PRM7 423 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 MSGN1A6NI15 193 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 NDUFA3O95167 84 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 SCGB1D1O95968 90 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 TYMSP04818 313 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 IL4P05112 153 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 OR2D3Q8NGH3 330 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 FBXL15Q9H469 300 aa4.74□□□□□ -1.65
POLK-215ENST00000514141 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms