RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 CHST6Q9GZX3 395 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 BAHCC1Q9P281 2608 aa3.09□□□□□ -1.91
STRADB-210ENST00000498648 ECM29Q5VYK3 1845 aa3.09□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TRAV4A0A0B4J268 109 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 A0A1B0GW54 56 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CYSRT1A8MQ03 144 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 PFDN1O60925 122 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 IGKV3-15P01624 115 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SRP19P09132 144 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ATP5G3P48201 142 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TAF6P49848 677 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 DEFA3P59666 94 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TBPL1P62380 186 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 LGALS9CQ6DKI2 356 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 Q6Q795 121 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 DHFR2Q86XF0 187 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 DAND5Q8N907 189 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 FAM107BQ9H098 131 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SPTBN4Q9H254 2564 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.08□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 EPG5Q9HCE0 2579 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 MYH1P12882 1939 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 A8MUU9 505 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 H3BMM0 161 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 LECT2O14960 151 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SH2D1AO60880 128 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SMIM17P0DL12 118 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 NPPCP23582 126 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CRYBB3P26998 211 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 G6PCP35575 357 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TPI1P60174 286 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 HBA1P69905 142 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 AMTNQ6UX39 209 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 UBALD1Q8TB05 177 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CD200R1Q8TD46 325 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 UBE2WQ96B02 151 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TOMM6Q96B49 74 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SERPINI1Q99574 410 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SPANXA1Q9NS26 97 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TVP23BQ9NYZ1 205 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 OR5V1Q9UGF6 321 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 OR52A1Q9UKL2 312 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CFAP54Q96N23 3096 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 MYH6P13533 1939 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ALPK3Q96L96 1907 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 DOCK9Q9BZ29 2069 aa3.07□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 A0A087WUU8 490 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SLC17A3O00476 420 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CSN2P05814 226 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 OR10J4P0C629 311 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 RHEBQ15382 184 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 USP34Q70CQ2 3546 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZNF720Q7Z2F6 126 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 MALSU1Q96EH3 234 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SPIN2AQ99865 258 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 EFCAB11Q9BUY7 163 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 C1orf50Q9BV19 199 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 EFCAB1Q9HAE3 211 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 U3KQK5 164 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 CHD6Q8TD26 2715 aa3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
STRADB-210ENST00000498648 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms