RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 FNDC10F2Z333 226 aa7□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-7P01780 117 aa7□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 SP9P0CG40 484 aa7□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 GABRG2P18507 467 aa7□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 LCNL1Q6ZST4 164 aa7□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 DOCK10Q96BY6 2186 aa7□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 SIVA1O15304 175 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 CER1O95813 267 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 FABP2P12104 132 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 OPRK1P41145 380 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 GLMPQ8WWB7 406 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 LRP4O75096 1905 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 REG1BP48304 166 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 C3AR1Q16581 482 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 MLANAQ16655 118 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 LINC01545Q5VT33 79 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 CDIP1Q9H305 208 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 PCSK5Q92824 1860 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 A6NDN8 102 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 PRSS46E5RG02 174 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 OR2J3O76001 311 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 LTAP01374 205 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-13P01766 116 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 RTL8BQ17RB0 113 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 TEPPQ6URK8 271 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM54Q969K7 222 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 VGLL1Q99990 258 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.99□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 TNCP24821 2201 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV4-34P06331 123 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 AREGP15514 252 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 ACP1P24666 158 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 CXCL12P48061 93 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 XGP55808 180 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 GNG5P63218 68 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 C10orf128Q5T292 105 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 OR10D3Q8NH80 312 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 GTSF1Q8WW33 167 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 TRIB1Q96RU8 372 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 DUSP13Q9UII6 198 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 JPT1Q9UK76 154 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 TECTAO75443 2155 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1B0GXF2 115 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 MGST3O14880 152 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 GCSHP23434 173 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 Q8TCH9 128 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 PROK2Q9HC23 129 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 FZR1Q9UM11 496 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 KALRNO60229 2985 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 AGRNO00468 2067 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 C10orf142B7Z368 130 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 SPINK8P0C7L1 97 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 NMUP48645 174 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 FAM27BQ5VT28 67 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 ASCL2Q99929 193 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 K7ESF4 209 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 LAMTOR5O43504 91 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 NGFP01138 241 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 ODF1Q14990 250 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3B-220ENST00000495571 PET117Q6UWS5 81 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms