RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462155.2

IFRD1-210, Transcript of interferon related developmental regulator 1, human

TSL 5

Gene IFRD1, Length 437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFRD1-210	ENST00000462155	WNT4	P56705	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	CATR1	Q13166	79 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155		Q6ZS49	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	METTL26	Q96S19	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155		Q9H3A6	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155		A0A1B0GU03	582 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	SNAPC5	O75971	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	UCHL1	P09936	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	DTYMK	P23919	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	RANBP1	P43487	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	NPBWR1	P48145	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	HAMP	P81172	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	OR51H1	Q8NH63	302 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	GFI1	Q99684	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155		A0A087WWL8	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	CIB2	O75838	187 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	PPP5C	P53041	499 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	HES5	Q5TA89	166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	COMMD9	Q9P000	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	ATP5G1	P05496	136 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	CRYBB3	P26998	211 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	FCGR2C	P31995	323 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	ATP5G3	P48201	142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	UCP3	P55916	312 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	LINC00315	P59091	139 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	ARPC4	P59998	168 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	MSMO1	Q15800	293 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155		M0QYG6	137 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	TMEM50A	O95807	157 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	KRAS	P01116	189 aa		4.51	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
IFRD1-210	ENST00000462155	GCSH	P23434	173 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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