RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0G2JLM5 398 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GUS0 222 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPPP2P59282 170 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKR1C1Q04828 323 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP5G2Q06055 141 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 MLANAQ16655 118 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 C15orf32Q32M92 178 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHDC1Q8N7A1 406 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF152Q8N8N0 203 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM116Q8NCL8 245 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4X1Q8NH49 305 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCARB1Q8WTV0 552 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMCO3A2RU48 225 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACSM6Q6P461 480 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM144Q7Z5S9 345 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC51BQ86UW2 128 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBAC2Q8NBM4 344 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACY3Q96HD9 319 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP6V0BQ99437 205 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TXN2Q99757 166 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLK15Q9H2R5 256 aa13.2□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPBWR1P48145 328 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 RND2P52198 227 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 MFAP4P55083 255 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEPPQ6URK8 271 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TREML4Q6UXN2 200 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5AU1Q8NGC0 362 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4X2Q8NGF9 303 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPIPB3Q92617 1050 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 C21orf62Q9NYP8 219 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR83OSQ9Y284 106 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF114Q9Y508 228 aa13.19□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNCP24821 2201 aa13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTORP42345 2549 aa13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 MFSD2BA6NFX1 497 aa13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPDU1O75352 247 aa13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCGB2A1O75556 95 aa13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM209BQ5JX69 171 aa13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 C10orf99Q6UWK7 81 aa13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 STOML3Q8TAV4 291 aa13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYOZ3Q8TDC0 251 aa13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAST4O15021 2626 aa13.17□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa13.17□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLN5O75503 358 aa13.17□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-48P01763 117 aa13.17□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPT1P13693 172 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB31Q13636 194 aa13.17□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTNL8Q6UX41 500 aa13.17□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF502Q8TBZ5 544 aa13.17□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGF7P21781 194 aa13.16□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 PROK1P58294 105 aa13.16□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFA5Q01523 94 aa13.16□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q56UQ5 140 aa13.16□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 THAP8Q8NA92 274 aa13.16□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2E2Q96LR5 201 aa13.16□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARV1Q9H2C2 271 aa13.16□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNG7O60262 68 aa13.15□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXL1Q12952 345 aa13.15□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAP18Q8IXM2 172 aa13.15□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF491Q8N8L2 437 aa13.15□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.15□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 GINS3Q9BRX5 216 aa13.15□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 S4R3C0 116 aa13.15□□□□□ -0.3
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFP92A6NM28 416 aa13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 F8W735 103 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10J1P30954 320 aa13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAMLGP49069 296 aa13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF343Q6P1L6 599 aa13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF709Q8N972 641 aa13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC140Q96MF4 163 aa13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRGV9Q99603 122 aa13.14□□□□□ -0.31
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPCDR1Q9BY65 106 aa13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms