RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 OR2J3O76001 311 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 TYMSP04818 313 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 TREML4Q6UXN2 200 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 CELA3BP08861 270 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 APELAP0DMC3 54 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 GLRXP35754 106 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 DCTN5Q9BTE1 182 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.57□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 NEU1Q99519 415 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 IGHV3-48P01763 117 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 GPX1P07203 203 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 CECR9P0C854 216 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 PRRX1P54821 245 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 COLCA1Q6ZS62 124 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ZGRF1Q86YA3 2104 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 LRRK2Q5S007 2527 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 LILRA1O75019 489 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 HIGD1CA8MV81 97 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 IFNL4K9M1U5 179 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 SNAI2O43623 268 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 C3orf79P0CE67 100 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 NPIPB3Q92617 1050 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ADAMTS20P59510 1910 aa9.56□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ARF6P62330 175 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 FAM222BQ8WU58 562 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 C5orf42Q9H799 3197 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 PEX7O00628 323 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 OR9G9P0C7N8 305 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 CDKN1AP38936 164 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 LCN12Q6JVE5 192 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 PNKDQ8N490 385 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 VKORC1Q9BQB6 163 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1B0GWJ7 208 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 25.7
CLSTN3-201ENST00000266546 IGLV3-1P01715 115 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 PSG7Q13046 419 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 UBE2V1Q13404 147 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF585BQ52M93 769 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM144Q7Z5S9 345 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 C9JCJ5 164 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 H3BTX0 84 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 CIDEAO60543 219 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 IGKV1D-33P01593 117 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 IGKV1-33P01594 117 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 GCSHP23434 173 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 MUC15Q8N387 334 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 RPEQ96AT9 228 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 CLEC3BP05452 202 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 NTF4P34130 210 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ATP5J2P56134 94 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 CCL8P80075 99 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 HCP5Q6MZN7 132 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 CCL13Q99616 98 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 MED13Q9UHV7 2174 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 IFI27L2Q9H2X8 130 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 DKK4Q9UBT3 224 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1W2PRE2 83 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms