RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022356.11

Usp54-201, Transcript of Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Usp54, Length 6,580 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54-201ENSMUST00000022356 Nxph3Q91VX5 252 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Dusp7Q91Z46 422 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Isg20Q9JL16 300 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 PrnA0A075B668 197 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm5225J3QPL3 108 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 VwceQ3U515 929 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr965Q7TRA7 312 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr530Q8VFE8 307 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 PrndQ9QUG3 179 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm13083A2AGW5 501 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Prr23a1G3UW32 258 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Vmn1r27K7N688 303 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 P04219 140 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Wnt3P17553 355 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Stfa2P35174 103 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Parp16Q7TMM8 322 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Dleu7Q8CHZ8 209 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr641Q8VGX6 312 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Eaf1Q9D4C5 268 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 PaplnQ9EPX2 1280 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Trav13d-3J3QMG8 112 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm28044L7N1X0 119 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Klf9O35739 244 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ube2l3P68037 154 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Fabp5Q05816 135 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Obox7Q4KL20 218 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tnfsf15Q5UBV8 252 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Spcs1Q9D958 161 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Prr30Q9D9B7 401 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm3550W4VSN7 160 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ceacam12Q3UKP4 300 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm10645Q3UPY1 145 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Alyref2Q9JJW6 218 aa6.93□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr1320A2AHM8 319 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 H60bB1B212 251 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Sod1P08228 154 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 GferP56213 198 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 PrkacbP68181 351 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Vdac2Q60930 295 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 MrgprfQ8VCJ6 343 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tmem144Q8VEH0 348 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr1228Q8VGM9 323 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Spns2Q91VM4 549 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Dnal4Q9DCM4 105 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr951Q9EQ94 314 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Cldn34dA2AGU5 210 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Shisa8J3QNX5 399 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Evi2aP20934 223 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Fam219bQ14DQ1 197 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Q5BN45 167 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 2210407C18RikQ6YI28 220 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr1015Q7TR94 312 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lsm11Q8BUV6 361 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 AdtrpQ8C138 230 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Exosc2Q8VBV3 293 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Galnt11Q921L8 608 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Sh2d6Q9D413 297 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Hdgfl3Q9JMG7 202 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ighv1-34A0A075B5V2 117 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Slc35e3Q6PGC7 313 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr591Q7TRR7 314 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pef1Q8BFY6 275 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr958Q8VEY3 312 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 SmagpQ99KC7 97 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Vsig2Q9Z109 328 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ighv3-4A0A0A6YXF1 117 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Mettl23A2AA28 253 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Il4P07750 140 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Klf1P46099 358 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 RimklaQ6PFX8 380 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Spink6Q8BT20 105 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 CcsapQ8QZT2 252 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tnfrsf13cQ9D8D0 175 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Smim23Q9DAL0 136 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Pxmp4Q9JJW0 212 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr685A0A1L1SVG7 331 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm21870J3QPN2 123 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Il2raP01590 268 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 P01783 136 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Fcer1aP20489 250 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 PkiaP63248 76 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm11232Q5SPI8 295 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Bricd5Q8BV89 174 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 GalmQ8K157 342 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Tmem97Q8VD00 176 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr354Q8VGJ8 317 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Parm1Q923D3 296 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Cldn13Q9Z0S4 211 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Znf385cA2A5E6 429 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gm10665K7N6B7 321 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Spi1P17433 272 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Ctdsp1P58466 261 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 2810408A11RikQ6NSU2 435 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Lrrtm1Q8K377 522 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Olfr1295Q8VF48 312 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Gpx4Q91XR9 253 aa6.92□□□□□ -1.3
Usp54-201ENSMUST00000022356 Mrps18bQ99N84 254 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.9 ms