RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589641.1

RFX2-213, Transcript of regulatory factor X2, human

TSL 3

Gene RFX2, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFX2-213	ENST00000589641	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	P2RX4	Q99571	388 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SMR3A	Q99954	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641		M0QZK8	103 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	JTB	O76095	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TSPAN15	O95858	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	IGHG2	P01859	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CD99	P14209	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	AREG	P15514	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CTRB1	P17538	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SNCA	P37840	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	MFAP2	P55001	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	RAB11A	P62491	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	GNB1	P62873	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	HBG1	P69891	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	HBG2	P69892	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ATP5S	Q99766	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	DFFB	O76075	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	IFNA4	P05014	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	REG1A	P05451	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	HNF1A	P20823	631 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	BLCAP	P62952	87 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	DLK1	P80370	383 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CD69	Q07108	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CLINT1	Q14677	625 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CORT	O00230	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	IGF1	P05019	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	APELA	P0DMC3	54 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SPP1	P10451	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms