RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.55□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM109Q9BVC6 243 aa3.55□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 FAM107BQ9H098 131 aa3.55□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 OR51V1Q9H2C8 321 aa3.55□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF556Q9HAH1 456 aa3.55□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.55□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 JPT1Q9UK76 154 aa3.55□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.55□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 UFC1Q9Y3C8 167 aa3.55□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 A0A1W2PPV4 95 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 H7C2Y5 167 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 AIPO00170 330 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 RAB29O14966 203 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 PRKYO43930 277 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 YPEL1O60688 119 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 HBZP02008 142 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 MT-ND4P03905 459 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 IGKV2-30P06310 120 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 STAG3L2P0CL84 134 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 CT45A6P0DMU7 189 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 CT45A5P0DMU8 189 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 CT45A7P0DMV0 189 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 PSMB6P28072 239 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 HCCSP53701 268 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 C6orf183Q5T699 404 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 GAPTQ8N292 157 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 PXT1Q8NFP0 134 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 YPEL2Q96QA6 119 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 TM2D1Q9BX74 207 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 Q9H3A6 140 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 MED4Q9NPJ6 270 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 ING4Q9UNL4 249 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 V9GYQ6 96 aa3.54□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 BBIP1A8MTZ0 92 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 TSPAN13O95857 204 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 MBP02144 154 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 IGKV1-16P04430 117 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 P0C879 139 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 SLC2A5P22732 501 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 RRM2P31350 389 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 MAGEA2P43356 314 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 HMGA2P52926 109 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 CCL18P55774 89 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM50BP56557 158 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 OXA1LQ15070 435 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 PIGYQ3MUY2 71 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 MEDAGQ5VYS4 303 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 C22orf42Q6IC83 251 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 PDPNQ86YL7 162 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 MTURNQ8N3F0 131 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 BEST4Q8NFU0 473 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 OR52I1Q8NGK6 324 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 PHB2Q99623 299 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.53□□□□□ -1.84
TRIM25-208ENST00000574234 A0A087X002 238 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM189A5PLL7 270 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC22O60826 627 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 GAS8-AS1O95177 125 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 SOX14O95416 240 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 IGLV2-23P01705 113 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 PRH1P02810 166 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 SEMG1P04279 462 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 SERPINE2P07093 398 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 OCM2P0CE71 109 aa3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TRIM25-208ENST00000574234 APELAP0DMC3 54 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms