RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 GPR146Q96CH1 333 aa5.96□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 GALNT14Q96FL9 552 aa5.96□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 BATF3Q9NR55 127 aa5.96□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 A0A0B4J2A0 478 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 OR2T8A6NH00 312 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 A6NHS1 94 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 P0C879 139 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SPCS3P61009 180 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 OR2C3Q8N628 320 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 OR1S1Q8NH92 325 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 CCDC140Q96MF4 163 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 PRR25Q96S07 402 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.95□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 K7EIL1 84 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 LYRM1O43325 122 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 TGOLN2O43493 480 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 GNG7O60262 68 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 NDUFB6O95139 128 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SFT2D2O95562 160 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 MT-CO2P00403 227 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 MFAP2P55001 183 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 PPP1R1AQ13522 171 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SMCO1Q147U7 214 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 KLK9Q2XQG4 91 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 C4orf46Q504U0 113 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 CASC10Q5T4H9 136 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 LCN12Q6JVE5 192 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 Q6ZRM9 215 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 CCDC32Q9BV29 185 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 PALMDQ9NP74 551 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 KLK9Q9UKQ9 250 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.94□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 CORTO00230 105 aa5.93□□□□□ -1.46
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SMG6-211ENST00000572369 IFNA10P01566 189 aa5.93□□□□□ -1.46
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SMG6-211ENST00000572369 CSN3P07498 182 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 HOXB5P09067 269 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 GP9P14770 177 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SPNP16150 400 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 OPRK1P41145 380 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 HTR2BP41595 481 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 MFAP4P55083 255 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ZNF846Q147U1 533 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SPSB3Q6PJ21 355 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 GPHB5Q86YW7 130 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ZNF114Q8NC26 417 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 DUSP18Q8NEJ0 188 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 OR52E5Q8NH55 327 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 COQ8AQ8NI60 647 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.93□□□□□ -1.46
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SMG6-211ENST00000572369 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.93□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 TRAV6A0A075B6T7 132 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 A0A1B0GU03 582 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 C9orf170A2RU37 121 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 C2orf70A6NJV1 201 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 K7EIM0 57 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 LGALS9O00182 355 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 SCGB2A1O75556 95 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 YIF1AO95070 293 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 IFNA21P01568 189 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 IGLV1-51P01701 117 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 OR4E1P0C645 316 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 NPBWR1P48145 328 aa5.92□□□□□ -1.46
SMG6-211ENST00000572369 RELQ04864 619 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
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