RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 EREGO14944 169 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 MYL12BO14950 172 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 WNT4P56705 351 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 CLDN12P56749 244 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 DHRS2Q13268 280 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 CLINT1Q14677 625 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 OR1P1Q8NH06 330 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 MOB3AQ96BX8 217 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM56Q96MV1 263 aa7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 H3BMM0 161 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 I3L2K1 104 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 LCE2BO14633 110 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 MT-CO2P00403 227 aa7.11□□□□□ -1.27
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KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3-48P01763 117 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 P2RY1P47900 373 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 ST3GAL4Q11206 333 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 CATR1Q13166 79 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 ICAM4Q14773 271 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 SSX7Q7RTT5 188 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.11□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 SULT1C2O00338 296 aa7.1□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 HBE1P02100 147 aa7.1□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 UCHL1P09936 223 aa7.1□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 DTYMKP23919 212 aa7.1□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 NPBWR1P48145 328 aa7.1□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 ALDH3B2P48448 385 aa7.1□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 FXYD7P58549 80 aa7.1□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 ERVK-16P61578 105 aa7.1□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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KDM5A-211ENST00000544777 CNIH2Q6PI25 160 aa7.1□□□□□ -1.27
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KDM5A-211ENST00000544777 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.1□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.1□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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KDM5A-211ENST00000544777 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.1□□□□□ -1.27
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KDM5A-211ENST00000544777 F5H768 121 aa7.09□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 SNAPC5O75971 98 aa7.09□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 CRYBB3P26998 211 aa7.09□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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KDM5A-211ENST00000544777 RRN3P1Q2M238 152 aa7.09□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 TPRA1Q86W33 373 aa7.09□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.09□□□□□ -1.27
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KDM5A-211ENST00000544777 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.09□□□□□ -1.27
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KDM5A-211ENST00000544777 NSG2Q9Y328 171 aa7.09□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.09□□□□□ -1.27
KDM5A-211ENST00000544777 A0A1B0GU03 582 aa7.08□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 IGKV3-20P01619 116 aa7.08□□□□□ -1.28
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KDM5A-211ENST00000544777 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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KDM5A-211ENST00000544777 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.08□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 MARCH11A6NNE9 402 aa7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM50AO95807 157 aa7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 PPP5CP53041 499 aa7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 ERVFC1-1P60608 527 aa7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 HES5Q5TA89 166 aa7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 OR51H1Q8NH63 302 aa7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM230Q96A57 120 aa7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 PRNDQ9UKY0 176 aa7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 V9GY05 133 aa7.07□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.06□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 CIB2O75838 187 aa7.06□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 DEFB130BP0DP73 79 aa7.06□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 DEFB130AP0DP74 79 aa7.06□□□□□ -1.28
KDM5A-211ENST00000544777 ARPC4P59998 168 aa7.06□□□□□ -1.28
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