RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 LTBP2Q14767 1821 aa3.84□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 SDK2Q58EX2 2172 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5K4A6NMS3 321 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP5HO75947 161 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV1-69P01742 117 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 ALOX5APP20292 161 aa3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1B-205ENST00000514178 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1B-205ENST00000514178 OR2T4Q8NH00 348 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 NMNAT3Q96T66 252 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR84Q9NQS5 396 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 DSCAMO60469 2012 aa3.82□□□□□ -1.8
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PGGT1B-205ENST00000514178 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.81□□□□□ -1.8
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PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1B0GV50 99 aa3.79□□□□□ -1.8
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PGGT1B-205ENST00000514178 DOCK1Q14185 1865 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 A8MUN3 132 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 H3BPC8 53 aa3.78□□□□□ -1.8
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PGGT1B-205ENST00000514178 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 ERVS71-1P61550 626 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 MMACHCQ9Y4U1 282 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-205ENST00000514178 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PGGT1B-205ENST00000514178 DOCK2Q92608 1830 aa3.77□□□□□ -1.81
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