RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483782.1

HFE-211, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 2

Gene HFE, Length 1,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-211ENST00000483782 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HFE-211ENST00000483782 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.85□□□□□ -0.51
HFE-211ENST00000483782 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa11.84□□□□□ -0.51
HFE-211ENST00000483782 APOA1P02647 267 aa11.84□□□□□ -0.51
HFE-211ENST00000483782 PAFAH1B2P68402 229 aa11.84□□□□□ -0.51
HFE-211ENST00000483782 ERHP84090 104 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HFE-211ENST00000483782 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HFE-211ENST00000483782 RARRES2Q99969 163 aa11.84□□□□□ -0.51
HFE-211ENST00000483782 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 IGHV3-48P01763 117 aa11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 TCF24Q7RTU0 167 aa11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 GBGT1Q8N5D6 347 aa11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 MFFQ9GZY8 342 aa11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 VSIRQ9H7M9 311 aa11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 COMMD3Q9UBI1 195 aa11.83□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.82□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.82□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 NPBWR1P48145 328 aa11.82□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 RND3P61587 244 aa11.82□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 TOMM20LQ6UXN7 152 aa11.82□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 DUSP18Q8NEJ0 188 aa11.82□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 ST8SIA2Q92186 375 aa11.82□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.82□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 A0A087WXM4 84 aa11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 ST8SIA3O43173 380 aa11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 DFFBO76075 338 aa11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 SPINK9Q5DT21 86 aa11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 ZNF600Q6ZNG1 722 aa11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 SLC35G3Q8N808 338 aa11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 OR11H2Q8NH07 326 aa11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 KMT2AQ03164 3969 aa11.8□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 M0QYG6 137 aa11.8□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 CORTO00230 105 aa11.8□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 IGKV1-5P01602 117 aa11.8□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 APOHP02749 345 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 P0C879 139 aa11.8□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 SNCAP37840 140 aa11.8□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa11.8□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.8□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.8□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 DEDDO75618 318 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 ATG12O94817 140 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 TNFAIP8O95379 198 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 PGAM2P15259 253 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 ELK1P19419 428 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 AKR1C2P52895 323 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 DEFB131AP59861 70 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 NCS1P62166 190 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 TMEM187Q14656 261 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 LILRB2Q8N423 598 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 FBXL17Q9UF56 701 aa11.79□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 A0A0B4J293 547 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 A0A1B0GU03 582 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 HPGDSO60760 199 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 TMEM50AO95807 157 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 IFNA17P01571 189 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 IFNA4P05014 189 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 PIGPP57054 158 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 LEMD1Q68G75 181 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 TP53RKQ96S44 253 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 PDCD10Q9BUL8 212 aa11.78□□□□□ -0.52
HFE-211ENST00000483782 SCGB2A1O75556 95 aa11.77□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 PI3P19957 117 aa11.77□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 TBPP20226 339 aa11.77□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 TCTAP57738 103 aa11.77□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 VBP1P61758 197 aa11.77□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.77□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.77□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 RABAC1Q9UI14 185 aa11.77□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa11.76□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 A0A1W2PS18 150 aa11.76□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 CLN5O75503 358 aa11.76□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 NPPCP23582 126 aa11.76□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 TRIM16LQ309B1 348 aa11.76□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.76□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 STHQ8IWL8 128 aa11.76□□□□□ -0.53
HFE-211ENST00000483782 C2CD4CQ8TF44 421 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 157.6 ms