RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	OR1P1	Q8NH06	330 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	S100Z	Q8WXG8	99 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	PEMT	Q9UBM1	199 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970		A0A0B4J2A0	478 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	LYRM1	O43325	122 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	SFT2D2	O95562	160 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	MT-CO2	P00403	227 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	HOXB5	P09067	269 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	SPN	P16150	400 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23	8e-8	■■□□□ 14
PSMD4-208	ENST00000462970	SMCO1	Q147U7	214 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC32	Q9BV29	185 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSMD4-208	ENST00000462970	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970		K7EIM0	57 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	PLA2G10	O15496	165 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	TGOLN2	O43493	480 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	CSN3	P07498	182 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	EDN2	P20800	178 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	BTC	P35070	178 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	MFAP4	P55083	255 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF846	Q147U1	533 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	RBKS	Q9H477	322 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970		A0A1B0GU03	582 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	C9orf170	A2RU37	121 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	C2orf70	A6NJV1	201 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	GNG7	O60262	68 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	YIF1A	O95070	293 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	IFNA10	P01566	189 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	OR4E1	P0C645	316 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	FOLR2	P14207	255 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	GP9	P14770	177 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	OPRK1	P41145	380 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	KLK9	Q2XQG4	91 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	NMS	Q5H8A3	153 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	LYG2	Q86SG7	212 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	GPHB5	Q86YW7	130 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF114	Q8NC26	417 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	COQ8A	Q8NI60	647 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	PALMD	Q9NP74	551 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970		I3L2K1	104 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	ADAP1	O75689	374 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	IFNA21	P01568	189 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	IGLV1-51	P01701	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	TCRB	P04435	133 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	IAPP	P10997	89 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	HTR2B	P41595	481 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	TNFRSF9	Q07011	255 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	DHRS2	Q13268	280 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	GUCA2B	Q16661	112 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	TM4SF20	Q53R12	229 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	LCN12	Q6JVE5	192 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	OR52E5	Q8NH55	327 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	DTD1	Q8TEA8	209 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	NUDT15	Q9NV35	164 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PSMD4-208	ENST00000462970	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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