RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 BOLA2Q9H3K6 86 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-205ENST00000462042 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-205ENST00000462042 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-205ENST00000462042 MIA2Q96PC5 1412 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-205ENST00000462042 KDM5BQ9UGL1 1544 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGGTB-205ENST00000462042 NCKAP5O14513 1909 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 DENND4CQ5VZ89 1909 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 COL4A2P08572 1712 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV41A0A0B4J266 112 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 PCNX2A6NKB5 2137 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 C3orf84H3BNL1 204 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
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RABGGTB-205ENST00000462042 GNG3P63215 75 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF90Q03938 601 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TERB2Q8NHR7 220 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 C2orf50Q96LR7 162 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TRABDQ9H4I3 376 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TOPBP1Q92547 1522 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SYNMO15061 1565 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TRBV19A0A075B6N1 114 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAPPC2LH3BP13 241 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 H7C2G1 150 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CBR1P16152 277 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP5G3P48201 142 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 DR1Q01658 176 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SPANXN3Q5MJ09 141 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF122Q9H9V4 155 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TVP23BQ9NYZ1 205 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SS18L2Q9UHA2 77 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SMPXQ9UHP9 88 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 PRNDQ9UKY0 176 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TIMM9Q9Y5J7 89 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 V9GYQ6 96 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 PPBPP02775 128 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SRIP30626 198 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 EMP1P54849 157 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM27BQ5VT28 67 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIQKQ629K1 86 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 LCA10Q71F78 164 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 OR52R1Q8NGF1 315 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 OR13C6PQ8NH95 151 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJC30Q96LL9 226 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 UFC1Q9Y3C8 167 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 PLXNA3P51805 1871 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 ICE1Q9Y2F5 2266 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC88CQ9P219 2028 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CLDN25C9JDP6 229 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CIAO1O76071 339 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 HES1Q14469 280 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 PFN4Q8NHR9 129 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CHST6Q9GZX3 395 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFB11Q9NX14 153 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 MED29Q9NX70 200 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 UBR2Q8IWV8 1755 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa2.42□□□□□ -2.02
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RABGGTB-205ENST00000462042 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC22A1O15245 554 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 MFSD11O43934 449 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CLPSP04118 112 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV1-16P04430 117 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SPI1P17947 270 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 PIGPP57054 158 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 NCALDP61601 193 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TPRXLQ17RH7 258 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF181Q2M3W8 571 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01554Q52M75 96 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 PCBD2Q9H0N5 130 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 ERGIC3Q9Y282 383 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 ADGRB3O60242 1522 aa2.42□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 DOCK4Q8N1I0 1966 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A0G2JQZ4 141 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 FNDC10F2Z333 226 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 G3V2T6 193 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 J3QRK9 145 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 RPSAP08865 295 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CASP1P29466 404 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 RHOBP62745 196 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 GNG5P63218 68 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 C3orf33Q6P1S2 294 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 MIR17HGQ75NE6 70 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa2.41□□□□□ -2.02
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