RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM223BA6NKX1 122 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1QBP02746 253 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRGV3P03979 118 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELANEP08246 267 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TPPP2P59282 170 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FOXE3Q13461 319 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR8G2PQ6IF36 304 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF329Q86UD4 541 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC01006Q8NI28 216 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0G2JLM5 398 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C15orf62A8K5M9 175 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMLR1H3BR10 107 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARPC5O15511 151 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHG4P01861 327 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LYL1P12980 280 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SULT1A1P50225 295 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RHOGP84095 191 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BSXQ3C1V8 233 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM209BQ5JX69 171 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NECAP1Q8NC96 275 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USMG5Q96IX5 58 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC35E1Q96K37 410 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CXorf58Q96LI9 332 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HYLS1Q96M11 299 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MS4A10Q96PG2 267 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR4C12Q96R67 309 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.04□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMCO3A2RU48 225 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H0YIZ8 118 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2J3O76001 311 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CST7O76096 145 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BRI3O95415 125 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM50AO95807 157 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRH1P02810 166 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C4BPBP20851 252 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 S100A11P31949 105 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAX9P55771 341 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CFHR3Q02985 330 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP5G2Q06055 141 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AQP10Q96PS8 301 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NEURL2Q9BR09 285 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNF126Q9BV68 326 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MFFQ9GZY8 342 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLXNB1O43157 2135 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.12
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGSF23A1L1A6 192 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HMSDA8MTL9 139 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DFFBO76075 338 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV1-40P01703 118 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB9AP51151 201 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AKR1C1Q04828 323 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2F1Q13607 317 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP6V1FQ16864 119 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C15orf32Q32M92 178 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q5BKY6 102 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACSM6Q6P461 480 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GGACTQ9BVM4 153 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSPB11Q9Y547 144 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms