RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 NOTCH4Q99466 2003 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 KLK13Q9UKR3 277 aa5.58□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf100A8MU93 164 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 K7ENP7 123 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 Q499Y3 187 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.57□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 LEPP41159 167 aa5.56□□□□□ -1.52
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RABGEF1-202ENST00000380828 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 LY6LH3BQJ8 138 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BSH0 61 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 GYPBP06028 91 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 ELOCQ15369 112 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZVL8 140 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGEF1-202ENST00000380828 CMC2Q9NRP2 79 aa5.56□□□□□ -1.52
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