RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTPRBP23467 1997 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A087X0K7 114 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TCF15Q12870 199 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR10D3Q8NH80 312 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM231BA6NCW3 169 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNHIT1O43257 154 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCGB1A1P11684 91 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LGALS7P47929 136 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FNDC10F2Z333 226 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR5AL1P0C617 328 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HOXC12P31275 282 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PIP4P1Q86T03 277 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM186Q96B77 213 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF503Q96F45 646 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMPD2O60906 423 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGHV3-9P01782 118 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMIM17P0DL12 118 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SSR4P51571 173 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DUSP13Q9UII6 198 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A1B0GXF2 115 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C9orf118A6NHY6 69 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 K7EP34 96 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COX8AP10176 69 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEACAM3P40198 252 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR1C1Q15619 314 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRSS33Q8NF86 280 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GCM1Q9NP62 436 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A096LPE4 126 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A1W2PPZ6 126 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 H3BRM9 83 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ACTL6BO94805 426 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TAS2R45P59539 299 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 Q0VFX4 171 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GABRA6Q16445 453 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SDK2Q58EX2 2172 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SP1P08047 785 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COL8A2P25067 703 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LINC00205P59089 165 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLGLB1Q02325 96 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AP1S3Q96PC3 154 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NABP2Q9BQ15 211 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LIPFP07098 398 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGFBP2P18065 325 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HTR1DP28221 377 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LINC00173Q6ZV60 143 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DEFB124Q8NES8 71 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCSK5Q92824 1860 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HAND1O96004 215 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FOXF2Q12947 444 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR86Q86TI4 376 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMPXQ9UHP9 88 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TCF19Q9Y242 345 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NCKAP5O14513 1909 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRSS47A8MTI9 375 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HIGD1CA8MV81 97 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AHRRA9YTQ3 701 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PSPNO60542 156 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERVK-16P61578 105 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NHLH1Q02575 133 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms