RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000048680.7

Hoxa9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa9, Length 3,226 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Zfp3Q8BLB0 497 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 NracQ8BNX7 165 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm10600Q8BQ57 223 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr1420Q8VF55 309 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Klf7Q99JB0 301 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Cdc42ep3Q9CQC5 254 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Ccdc54Q9DAL3 329 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Celsr1O35161 3034 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Lrrc29A0A1B0GQY9 621 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr1329L7MTV4 313 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gstp1P19157 210 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 H2-DMaP28078 261 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Taar5Q5QD14 337 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Klk1b21Q61759 261 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Iqcf4Q6P8Y2 204 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Rbm14Q8C2Q3 669 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr484Q8VFD3 321 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr926Q9EQ98 308 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Ms4a4bQ9ES61 226 aa10.01□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Kcnk15B2RVL1 343 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr555E9Q547 315 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Casp16-psI6L890 176 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm5039J3QNT6 144 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Kcns2O35174 477 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Rnase2bO35292 155 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 VhlP40338 181 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 ShbgP97497 403 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr181Q8VGQ7 317 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Tm7sf3Q9CRG1 565 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm9817Q9D2M0 144 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Wnt16Q9QYS1 364 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Fzr1Q9R1K5 493 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Usf3B2RUQ2 2221 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Hsf1P38532 525 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Trdv4Q5R1A3 115 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Cd55bQ61476 407 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr1299Q7TQX5 312 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Prrg4Q8BGN6 226 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr1141Q8VFQ7 311 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Chrdl1Q920C1 447 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gng10Q9CXP8 68 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Wbp2nlQ9D529 359 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Zfp407G3UVV3 2246 aa10□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm20815J3KMI0 227 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm28051J3QMA2 81 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm20914J3QME2 227 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Dkk1O54908 272 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 GzmaP11032 260 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Mcpt8P43430 247 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Otx2P80206 289 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Cln6Q3U466 308 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gfod1Q3UHD2 390 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Lclat1Q3UN02 376 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm21292Q78EE2 227 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr1290Q7TQX8 312 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Nmes1Q810Q5 83 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Aqp11Q8BHH1 271 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 9430097D07RikQ8BS47 195 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Poc1aQ8JZX3 405 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr1444Q8VFX2 319 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Rwdd3Q8VIL2 267 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Ear10Q923L6 156 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Rbm7Q9CQT2 265 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Cst6Q9D1B1 149 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Sgms2Q9D4B1 365 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Igkv14-100A0A0G2JG36 117 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Fkbp8O35465 402 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Hoxa5P09021 270 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Hist1h2bmP10854 126 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Cdx1P18111 268 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Slc6a9P28571 692 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Pax5Q02650 391 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Hist1h2bhQ64478 126 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Hist2h2bbQ64525 126 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Hist1h2bcQ6ZWY9 126 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm5771Q792Y9 245 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Lrtm1Q8BXQ3 356 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr281Q8VET6 311 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr136Q8VG72 312 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Olfr1294Q8VGE5 312 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Wasf3Q8VHI6 501 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Cds2Q99L43 444 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Slc29a3Q99P65 475 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Mdp1Q9D967 164 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 RprmQ9JJ72 109 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Hnf4gQ9WUU6 408 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 S1pr3Q9Z0U9 378 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Dmxl2Q8BPN8 3032 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm29049A0A087WSM5 227 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm39566A0A1B0GT45 1251 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm21118J3QPK8 227 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Tcstv1O70619 171 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Foxh1O88621 401 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Csn2P10598 231 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 SellP18337 372 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Tnfsf8P32972 239 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Tcl1b1P56840 116 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Ear1P97426 155 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm20909Q5FWB5 227 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxa9-201ENSMUST00000048680 Gm20852Q5M8R5 227 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.1 ms