RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618318.1

RPRD1B-208, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-208ENST00000618318 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 BTBD17A6NE02 478 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 C15orf62A8K5M9 175 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 IGHV1-69P01742 117 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 HBE1P02100 147 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 FAM157CP0CG43 387 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 TMEM11P17152 192 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 TNXAQ16473 311 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 VWC2Q2TAL6 325 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 LINC01559Q495D7 138 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 COMMD7Q86VX2 200 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 CFHR4Q92496 578 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 NRGNQ92686 78 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 REG4Q9BYZ8 158 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 SMCO3A2RU48 225 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 RAB19A4D1S5 217 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 NDUFA3O95167 84 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 CA2P00918 260 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 OPN1MWP04001 364 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 OR13C7P0DN81 318 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 FGF7P21781 194 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 SAA4P35542 130 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 ARL16Q0P5N6 197 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 HNF4GQ14541 408 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 Q5PR19 223 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 UQCC3Q6UW78 93 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 LFNGQ8NES3 379 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 SLC35E1Q96K37 410 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 CITED4Q96RK1 184 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 FBXL15Q9H469 300 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 AKAP9Q99996 3911 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 TSPAN15O95858 294 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 TGFAP01135 160 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 GNB1P62873 340 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 AKR1C1Q04828 323 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 FXYD3Q14802 87 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 BSXQ3C1V8 233 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 TEPPQ6URK8 271 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 BTNL8Q6UX41 500 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 Q6ZRG5 221 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 RITA1Q96K30 269 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 TMEM68Q96MH6 324 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 ARID1AO14497 2285 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 FBP1P09467 338 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 KRTAP10-9P60411 292 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 CD69Q07108 199 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 ZNF616Q08AN1 781 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 PEA15Q15121 130 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 AANATQ16613 207 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.3□□□□□ -1.4
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RPRD1B-208ENST00000618318 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 Q8N6K4 173 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 ZNF114Q8NC26 417 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 OR1P1Q8NH06 330 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 NANPQ8TBE9 248 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 HRH4Q9H3N8 390 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-208ENST00000618318 THYN1Q9P016 225 aa6.3□□□□□ -1.4
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