RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 YPEL4Q96NS1 127 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAF16Q9NXF7 216 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 SMCO3A2RU48 225 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP92A6NM28 416 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN9O75954 239 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 APOA2P02652 100 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 AKIRIN2Q53H80 203 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 C1QL4Q86Z23 238 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF137PP52743 207 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4A5Q8NH83 315 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA3Q8NHX4 192 aa20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 NPVFQ9HCQ7 196 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 INS-IGF2F8WCM5 200 aa20.62■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 MMP23AO75900 390 aa20.62■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC24A4Q8NFF2 622 aa20.62■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 OR13D1Q8NGV5 346 aa20.62■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 TRAV3A0A0B4J244 114 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 NPY1RP25929 384 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 GNG10P50151 68 aa20.61■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR5AN1Q8NGI8 311 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 KBTBD11O94819 623 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV3-7P01780 117 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 AKR1C3P42330 323 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 UTF1Q5T230 341 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TREML4Q6UXN2 200 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB24Q969Q5 203 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 CTDSP1Q9GZU7 261 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 OR51B2Q9Y5P1 312 aa20.6■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 TNFRSF14Q92956 283 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 SDF2L1Q9HCN8 221 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PPH5 198 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM155Q4W5P6 130 aa20.59■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 VSTM2AQ8TAG5 236 aa20.59■□□□□ 0.89
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CAPNS1-204ENST00000587718 DLX6P56179 175 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM170AQ8WVE7 144 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A22Q9H936 323 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHA3Q9HB20 300 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 NAT8Q9UHE5 227 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 SVEP1Q4LDE5 3571 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PPE2 198 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 FBP1P09467 338 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CD81P60033 236 aa20.57■□□□□ 0.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 BSXQ3C1V8 233 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf83Q53S99 150 aa20.56■□□□□ 0.88
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CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD12Q8N2K0 398 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1L8Q8NGR8 309 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 OR9G1Q8NH87 305 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 GGTLC1Q9BX51 225 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 H0YJW9 148 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 J3QR06 171 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 DVL1O14640 695 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 RBP4P02753 201 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL29P47914 159 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 CEBPGP53567 150 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 TEPPQ6URK8 271 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM24BQ8N5W8 94 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF727A8MUV8 499 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 FCN3O75636 299 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-204ENST00000587718 MC5RP33032 325 aa20.55■□□□□ 0.88
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