RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	CHST1	O43916	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	CA2	P00918	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	IFNA17	P01571	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	CRYGC	P07315	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	CD24	P25063	80 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	CNTFR	P26992	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	HTR2B	P41595	481 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	OR2B8P	P59922	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	RAP2B	P61225	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SLC35B1	P78383	322 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	CX3CL1	P78423	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	IL15RA	Q13261	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	FXYD3	Q14802	87 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TNXA	Q16473	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	LY6E	Q16553	131 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		Q8N1X5	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		E5RGE8	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	GOSR2	O14653	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TSC22D2	O75157	780 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	ADAP1	O75689	374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	ELANE	P08246	267 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	HKR1	P10072	659 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	PSMB6	P28072	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SNCA	P37840	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	BCAP31	P51572	246 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	H2BFS	P57053	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	FOXL1	Q12952	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		Q6ZRM9	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	STPG2	Q8N412	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CHP1-208	ENST00000560965	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965		A0A0G2JLM5	398 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	FCN1	O00602	326 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	DEDD	O75618	318 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	MPC2	O95563	127 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	IGHG4	P01861	327 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	LYL1	P12980	280 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	CTRB1	P17538	263 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	CXCL3	P19876	107 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	PAX6	P26367	422 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	P2RY1	P47900	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	RAB11A	P62491	216 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	BLCAP	P62952	87 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	CFHR3	Q02985	330 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CHP1-208	ENST00000560965	BAX	Q07812	192 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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