RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556272.1

PCNX1-211, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 2

Gene PCNX1, Length 2,942 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-211ENST00000556272 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 F6UZH7 168 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 SPINT2O43291 252 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 LINC00614P0C842 121 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 FGF7P21781 194 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 NBL1P41271 181 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 PDLIM4P50479 330 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 TMPRSS3P57727 454 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 JPT1Q9UK76 154 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 CFAP54Q96N23 3096 aa6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 H7BYZ3 331 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 S1PR2O95136 353 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 IGKV1D-33P01593 117 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 IGKV1-33P01594 117 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF415Q09FC8 603 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 OR1L1Q8NH94 360 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 PARLQ9H300 379 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 CLN8Q9UBY8 286 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 PPP5D1E7EU14 171 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 HPRT1P00492 218 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 SOD3P08294 240 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 PAX1P15863 534 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 GZMHP20718 246 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 G6PCP35575 357 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 PKIAP61925 76 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 C3AR1Q16581 482 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 S100PBPQ96BU1 408 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ARID1AO14497 2285 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 MLNRO43193 412 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 RAMP3O60896 148 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 IGLV1-44P01699 117 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 GATA3P23771 443 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 OPRK1P41145 380 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 GALR1P47211 349 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ARG2P78540 354 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ADIRFQ15847 76 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 WDR82Q6UXN9 313 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 TIMD4Q96H15 378 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.05□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF292O60281 2723 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 FNDC10F2Z333 226 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 YPEL1O60688 119 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 KRASP01116 189 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 CDSNQ15517 529 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 COX19Q49B96 90 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 OR4X1Q8NH49 305 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF503Q96F45 646 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 YPEL2Q96QA6 119 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 PTPRBP23467 1997 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 C17orf98A8MV24 154 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 TSTD3H0UI37 97 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 C15orf65H3BRN8 121 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ZG16O60844 167 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 GCGP01275 180 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 MPV17P39210 176 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 GABRA2P47869 451 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 RBX1P62877 108 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 ZNF383Q8NA42 475 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 OR1P1Q8NH06 330 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 SGK494Q96LW2 274 aa6.04□□□□□ -1.44
PCNX1-211ENST00000556272 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.04□□□□□ -1.44
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