RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 CRYGAP11844 174 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 DLX6P56179 175 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 EBPQ15125 230 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLEC12BQ2HXU8 276 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 LYG2Q86SG7 212 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR7G1Q8NGA0 311 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR4E2Q8NGC2 313 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 PSMF1Q92530 271 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 MED10Q9BTT4 135 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC22A4Q9H015 551 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 HRASLSQ9HDD0 168 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR84Q9NQS5 396 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 FUT9Q9Y231 359 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIAA0232Q92628 1395 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 A0A1B0GW15 77 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 FABP5P3A8MUU1 101 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 TCL1BO95988 128 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 LINC01554Q52M75 96 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 SYPL2Q5VXT5 272 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 DPPA3Q6W0C5 159 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRR15Q8IV56 129 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR10D3Q8NH80 312 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 BBS2Q9BXC9 721 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 MROQ9BYG7 248 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 METTL9Q9H1A3 318 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 CXorf21Q9HAI6 301 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 KDM6BO15054 1643 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF292O60281 2723 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCL16O15467 120 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 NUPR1O60356 82 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 PROSCO94903 275 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 SRP19P09132 144 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 MGST1P10620 155 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 MIPP30301 263 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 RPS24P62847 133 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 SMAGPQ0VAQ4 97 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDKL4Q5MAI5 379 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR52E4Q8NGH9 312 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR2T4Q8NH00 348 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR2T27Q8NH04 317 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR5AK3PQ8NH89 298 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 RASSF5Q8WWW0 418 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 GINS4Q9BRT9 223 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 IL36BQ9NZH7 164 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 AK3Q9UIJ7 227 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-397P-201ENST00000516226 HIVEP1P15822 2718 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAST2Q6P0Q8 1798 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 A0A0D9SG52 128 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 DAPL1A0PJW8 107 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 RAB19A4D1S5 217 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 SULT1C2O00338 296 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 SGCEO43556 437 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 NEMFO60524 1076 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 GP1BAP07359 652 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCL4P13236 92 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 CXCL2P19875 107 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 CXCL3P19876 107 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 CASQ1P31415 396 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 KISS1Q15726 138 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 DEFB113Q30KQ7 82 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 RIC1Q4ADV7 1423 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 CRLF3Q8IUI8 442 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 PFN4Q8NHR9 129 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 MIXL1Q9H2W2 232 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 HES4Q9HCC6 221 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 C14orf105Q9NVL8 296 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 A0A1W2PP64 1363 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 PIK3R4Q99570 1358 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 LST1O00453 97 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 TNFAIP8O95379 198 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 RHEBQ15382 184 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 KHDC3LQ587J8 217 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 C5orf46Q6UWT4 87 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 UBL4BQ8N7F7 174 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR32P1Q8NGA4 272 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 STOML3Q8TAV4 291 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 AGR3Q8TD06 166 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa-0.86□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms