RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.33□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MED13LQ71F56 2210 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CGB1A6NKQ9 187 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SOX15O60248 233 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ACTL6BO94805 426 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MOSP00540 346 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 HBE1P02100 147 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MBP02144 154 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CNTFRP26992 372 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB2AP61019 212 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SSX2Q16385 188 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TREM1Q9NP99 234 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 RPRMQ9NS64 109 aa8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CUBNO60494 3623 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 E7EUB6 86 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 NBR2O15453 112 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV1D-33P01593 117 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV1-33P01594 117 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 WT1-ASQ06250 92 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 PAX8Q06710 450 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 PLGLAQ15195 96 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MMDQ15546 238 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TNXAQ16473 311 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ACSM6Q6P461 480 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TREML4Q6UXN2 200 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 NPBQ8NG41 125 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 FBXL15Q9H469 300 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.31□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GV50 99 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GW64 132 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM218A2RU14 115 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CD5P06127 495 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 OR13C7P0DN81 318 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC25A16P16260 332 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 OPRK1P41145 380 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 RIPPLY3P57055 190 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 GNB1P62873 340 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 AKR1C1Q04828 323 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB31Q13636 194 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 HES1Q14469 280 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 HNF4GQ14541 408 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 PEA15Q15121 130 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 GUK1Q16774 197 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MALSU1Q96EH3 234 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 MGST2Q99735 147 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 VSIRQ9H7M9 311 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA1456Q9P272 454 aa8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 NPFFO15130 113 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFA3O95167 84 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CD99P14209 185 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SAA4P35542 130 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CD69Q07108 199 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 EBI3Q14213 229 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF726P1Q15940 193 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 TEPPQ6URK8 271 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8N6K4 173 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF114Q8NC26 417 aa8.29□□□□□ -1.08
GTPBP1-211ENST00000487538 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms