RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472420.5

LRPPRC-208, Transcript of leucine rich pentatricopeptide repeat containing, human

TSL 2

Gene LRPPRC, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRPPRC-208	ENST00000472420	CASQ1	P31415	396 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	PRR4	Q16378	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	S100A13	Q99584	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	USH2A	O75445	5202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420		J3QRK9	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	MRAS	O14807	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	CCNB2	O95067	398 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	RAB3A	P20336	220 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	P2RY1	P47900	373 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	PSG9	Q00887	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	RCN1	Q15293	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420		K7EIM0	57 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	TNFRSF11B	O00300	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	LECT2	O14960	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	AZU1	P20160	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	PAX9	P55771	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	GINS1	Q14691	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420		Q9HAA7	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	GID8	Q9NWU2	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	OGG1	O15527	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	CCNK	O75909	580 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	FABP3	P05413	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	CD1A	P06126	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	B2M	P61769	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	GPR176	Q14439	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	TBX5	Q99593	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	RAB27B	O00194	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	PDCD6	O75340	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	HLA-G	P17693	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	MAL	P21145	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	NPPC	P23582	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	DEFB1	P60022	68 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF79	Q15937	498 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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