RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462155.2

IFRD1-210, Transcript of interferon related developmental regulator 1, human

TSL 5

Gene IFRD1, Length 437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFRD1-210	ENST00000462155	P2RY14	Q15391	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	SSX1	Q16384	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	SLC22A5	O76082	557 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	CDK1	P06493	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	SERPINE2	P07093	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	CTSG	P08311	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	XG	P55808	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	GNGT1	P63211	74 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	DLK1	P80370	383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	MLANA	Q16655	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155		K7EIM0	57 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	NUDT3	O95989	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	CD1A	P06126	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	TALDO1	P37837	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	CCL18	P55774	89 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	INSL4	Q14641	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	RCN1	Q15293	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	XP32	Q5T750	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155		Q6ZSN1	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	APH1B	Q8WW43	257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFRD1-210	ENST00000462155		A0A075B6Q4	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155		K7EQG2	157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	UPK2	O00526	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	TNFSF12	O43508	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFRD1-210	ENST00000462155	GNG7	O60262	68 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms