RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 K7EMT4 169 aa15.63■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 S100GP29377 79 aa15.63■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 WFDC3Q8IUB2 231 aa15.63■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 SCPEP1Q9HB40 452 aa15.63■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 NSG2Q9Y328 171 aa15.63■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 ALMS1Q8TCU4 4167 aa15.63■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 TNFAIP8O95379 198 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 APOA1P02647 267 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 LSM3P62310 102 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 OR1P1Q8NH06 330 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 CHRDL1Q9BU40 450 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 HINT2Q9BX68 163 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 C15orf62A8K5M9 175 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DMAP28067 261 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 ADMP35318 185 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 APOC4P55056 127 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 UCP3P55916 312 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZWC4 215 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF114Q8NC26 417 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 DBX1A6NMT0 343 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 RCVRNP35243 200 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 SEC22AQ96IW7 307 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2CO00762 179 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN5P62079 268 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D26Q86UD7 250 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DL5AQ8N109 375 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 COMMD3Q9UBI1 195 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-208ENST00000428064 OR4C46A6NHA9 309 aa15.58■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 CTSGP08311 255 aa15.58■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 RELQ04864 619 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF9Q07011 255 aa15.58■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 Q56UQ5 140 aa15.58■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 UBAC2Q8NBM4 344 aa15.58■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF414Q96IQ9 312 aa15.58■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 OR10C1Q96KK4 312 aa15.58■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 TXN2Q99757 166 aa15.58■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1-39P01597 117 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1D-39P04432 117 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 BMI1P35226 326 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 PRCDQ00LT1 54 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 FUNDC2Q9BWH2 189 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 I3L2K1 104 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 NCS1P62166 190 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 OR4A16Q8NH70 328 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 SMPXQ9UHP9 88 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 SPRY2O43597 315 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 MFAP4P55083 255 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 RND3P61587 244 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa15.54■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 ELK1P19419 428 aa15.54■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 VBP1P61758 197 aa15.54■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 MRGPRFQ96AM1 343 aa15.54■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 GALNT14Q96FL9 552 aa15.54■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0J9YWU9 116 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 CHEK1O14757 476 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB135Q30KP9 77 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 LYG2Q86SG7 212 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 LHFPL1Q86WI0 220 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 STPG3Q8N7X2 389 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 RNF183Q96D59 192 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 MISP3Q96FF7 219 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 RNF2Q99496 336 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 NUPR2A6NF83 97 aa15.52■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 INS-IGF2F8WCM5 200 aa15.52■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 HPGDSO60760 199 aa15.52■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 MT-CO2P00403 227 aa15.52■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 RORCP51449 518 aa15.52■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 ARRDC1Q8N5I2 433 aa15.52■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM116Q8NCL8 245 aa15.52■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa15.52■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 MAP6D1Q9H9H5 199 aa15.52■□□□□ 0.08
LIMS1-208ENST00000428064 CD5P06127 495 aa15.51■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 TBPP20226 339 aa15.51■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00476Q8WZB0 136 aa15.51■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms